공모주 시장의 단기 변동성을 줄이기 위해 도입되는 코너스톤 투자자 제도가 시장 간 양극화를 키울 수 있다는 지적이 나온다. 현금흐름이 안정적이고 공모 규모가 큰 코스피에 자금이 집중돼 수급 안정이 더 필요한 코스닥 스몰캡(중소형주)은 장기 투자자를 확보하기 어려울 수 있다는 지적이다.