Deep Learning-driven De novo Sequencing to Identify Unmapped Peptides in Pan-cancer Global and Phospho-proteomes
이공학학술연구기반구축(R&D) · 박사과정생연구장려금지원
2026년
2340065243
교육부
한국연구재단
경희대학교
박승민
1명
2026.09.01 ~ 2027.02.28
2026.09.01 ~ 2028.08.31
1,250만원
1,250만원
기초연구
대학
서울특별시 동대문구
생명과학 > 융합바이오 > 생물정보학
대규모 Pan-cancer 글로벌 및 인산화 단백체 데이터로부터 기존 데이터베이스 검색으로 식별되지 않는 'Unmapped Peptide(미식별 펩타이드)'를 발굴하고 그 생물학적 기능을 주석(Annotation)하는 'AI 기반 De novo 시퀀싱 및 생명정보학 분석 통합 파이프라인(FDR < 0.05 통제)'을 구축하는 것을 최종 목표로 함.세부 추진 목표는 ...
[1차년도: 기반 인프라 구축 및 AI 모델 초기 연동]1) 대규모 GPU 연산에 최적화된 로컬 서버 환경 구축 및 기확보된 Pan-cancer 조직 단백체 데이터(글로벌 및 인산화) 통합 병합.2) 데이터 병합 시 발생하는 배치 효과(Batch effect) 보정 및 스펙트럼 노이즈 1차 필터링 수행.3) MSFragger 등 초고속 Open-search 알고리즘을 ...
... GitHub 등 플랫폼에 배포함. 이를 통해 전 세계 연구자들이 난치성 질환의 질량 분석 데이터 재분석에 즉각적으로 활용할 수 있게 지원함.후속 중개 연구 기반 마련: 규명된 암종별 특이 ... 전공자가 단순히 완성된 툴을 사용하는 것을 넘어, 딥러닝 알고리즘을 직접 튜닝하고 대용량 데이터를 통제하는 고도화된 데이터 엔지니어링 원천 기술을 확보함으로써 국가 바이오 빅데이터 분석 경쟁력 ...