Development of High-Throughput Single-Cell LINE-1 Profiling Technology for Lineage Tracing of Heterogeneous Cell Variants in Cancer Evolution
개인기초연구(과기정통부)(R&D) · 우수연구-핵심연구(기본연구B)
2026년
2710113652
과학기술정보통신부
한국연구재단
한양대학교산학협력단
허준호
2명
2026.09.01 ~ 2027.08.31
2026.09.01 ~ 2027.08.31
6,000만원
6,000만원
기초연구
대학
서울특별시 성동구
생명과학 > 유전학·유전체학 > 분자유전학
... 진화과정에서 나타나는 이질적 세포 변이들의 경로와 클론 계통을 단일세포 수준에서 추적 분석하는 플랫폼을 구축하는 것임. 본 연구팀은 담도암 발생 및 진화 오가노이드 모델을 기 제작하였으며, 이를 ... 수행하여 각 세포에 이질적으로 발생하는 신규 LINE-1 체세포 삽입위치를 프로파일링하고, 위 데이터들을 통합해 암 발생 및 진화 과정의 세포 변이 계통을 추적하는 분석 파이프라인 구축
... 이를 통해 암 발생 및 진화 과정에 있는 세포(P1-P7) 의 LINE-1 삽입위치 시퀀싱 데이터에서 신규 LINE-1 체세포 삽입 정보를 포함한 유효 데이터의 비율을 기존 약 0.1%에서 ... 암 진화 과정에서의 LINE-1 과 암 연관 RNA 발현 변화를 민감하게 검출하는 고효율 플랫폼을 구축할 것임. 전장 전사체 라이브러리에 dCas9-trap을 적용하면 LINE-1 RNA와 ...
... 선택 제거 기술을 융합하여 단일 세포 신규 LINE-1 체세포 삽입위치를 분석하는 고효율 플랫폼은 세포의 발달 및 질환 발생과정에서 전체(bulk) 세포 분석에서 측정하기 어려운 세포집단 ... 단일세포 ATAC-seq을 활용한 단일세포 LINE-1 체세포 신규삽입 지도와 염색질 상태 데이터들을 결합하여 평균 신호에 가려진 희귀 하위 클론 세포군 또는 비균질적 세포 전환 경로를 검출하고 ...