Development of a functional variant annotation and prediction system for crop NGS-derived variants (SNPs and indels)
이공학학술연구기반구축(R&D) · 기본연구B(포용형)
2026년
2340064560
교육부
한국연구재단
서울대학교산학협력단
김규원
1명
2026.09.01 ~ 2027.02.28
2026.09.01 ~ 2029.08.31
3,000만원
3,000만원
기초연구
대학
서울특별시 관악구
농림수산식품 > 식량작물과학 > 식량작물 유전/육종
... variant position, gene annotation indexing 방법 확립■ Functional variant position, gene annotation query response 엔진 개발■ functional variant annotation 대상 작물의 확장■ functional variant annotation 소프트웨어의 장기적 사용성 확립
■ 컴퓨터 자료구조론이 동원되는 설계■ 작물별로 서로 다른 gene annotation 이 가능한 시스템 개발■ 컴퓨터 자원을 효율적으로 활용하는 분산형 stand alone 시스템으로 자신만의 연구재료 분석 소프트웨어 개발■ 작물별 정규화 클래스를 생성 및 작물별 소프트웨어 프레임워크를 구축
■ 대상 작물의 확장: 한 가지 작물 뿐 아니라 여러 작물에서 적용■ GWAS 후 haplotype analysis에 활용■ CRISPR/Cas9 후 유전자 검증에 활용