Protein Networks Visualization of Lysine and Cysteine-PTMs in Rice using DIA-MS
개인기초연구(과기정통부)(R&D) · 우수연구-중견연구/후속(유형1)
2026년
2710115332
과학기술정보통신부
한국연구재단
부산대학교
김선태
11명
2026.05.01 ~ 2027.04.30
2024.05.01 ~ 2029.04.30
1.8억원
1.8억원
기초연구
대학
부산광역시 금정구
농림수산식품 > 식량작물과학 > 식량작물 생명공학
○ 기존 단백질 PTMs 분리 및 정량 분석 한계를 극복하는 DIA-MS 분석으로 처리/조직별 Lysine과 Cysteine PTMs 다이너믹스 데이터 세계 최초 확보 및 RicePTMs Viewer 개발. ○ 벼 PTMs 데이터 시각화 ?내용 1: 벼 Lysine과 Cysteine PTMs 단백질 용해 및 분리, 동정 기술의 체계적 분석 최적화...
...n, S-nitrosylation 특이적 변형 펩타이드들의 Orbitrap exploris 480 (LC-MS/MS)를 이용한 단백질체 분석 수행○ MaxQuant 및 Perseus 소프트웨어를 활용한 rawdata 분석 수행.○ Gene ontology, KEGG, MapMan 분석을 활용한 변형 단백질체들의 기능 분석 수행○ 동정된 특이적 변형 단백질체들의 protein-protein ...
1) 연구과제의 활용방안 ○ 본 연구에서 얻은 PTMs 단백질체 정보를 기반으로 Proteogenome 및 유전체 고도화 분석. 단백질체 분석 방법 관련 연구자들에게 정보 및 분석 지원 제공 ○ 새로운 PTMs 단백질 분리 및 분석 기술에 대한 지적 재산권 출원 및 논문 게재 ○ PTMs 단백질 in-depth 표준지도 및 proteome-bioinform...