Identification and Diagnostic Application of Tumor Center and Invasive Front Gene Signatures Based on Spatial-Genomic Heterogeneity
개인기초연구(과기정통부)(R&D) · 우수연구-핵심연구(기본연구B)
2026년
2710113391
과학기술정보통신부
한국연구재단
을지대학교성남캠퍼스
황영선
1명
2026.09.01 ~ 2027.08.31
2026.09.01 ~ 2031.08.31
6,333만원
6,333만원
기초연구
대학
경기도 성남시
보건의료 > 치의과학 > 구강생물학
#최종연구목표; 구강암의 종양중심부(Tumor Center, TC)와 침윤경계면(Invasive Front, IF)에서 나타나는 공간-유전체 이질성을 규명하고, 이를 기반으로 TC와 IF의 유전자 시그니처를(Gene Signature) 개발하여, 진단·예후·치료에 활용하고자 함.# 연구배경 및 필요성(1) 구강암의 구강편평상피세포암(Oral Squamous...
... 준비, FFPE tissue 확보]; 단일세포 전사체(scRNA-seq) 분석; 10x Genomic 플랫폼 이용 ; 공간 전사체(spatial transcriptomics, ST) 분석 (10x Visium): Space Ranger를 이용해 read 정렬 및 spot 품질 QC를 수행하고, H ST 데이터 처리, 클러스터 주석(annotation), 세포 유형 디컨볼루션, 생물정보학적 특징 추출 [차원축소(PCA, ...
... 항침윤·항전이 치료제 개발을 위한 표적 후보로 응용될 수 있음③ TC, IF 유전자 시그니처를 전임상 단계의 약물 스크리닝 패널로 구축할 수 있음④ 공간 전사체(ST)와 H&E 판독이 통합된 데이터를 기반으로, 침윤경계면(IF)을 자동 검출하는 AI 학습 데이터셋을 구축할 수 있음 (3) 기대효과# 학문적 기대효과 ① 구강암의 공간적 이질성, 특히 종양중심부와 침윤경계면 이질성의 ...