Development of a Hybrid tsRNA Sequencing for Accurate Profiling in Low Input Samples
이공학학술연구기반구축(R&D) · 박사과정생연구장려금지원
2026년
2340065155
교육부
한국연구재단
중앙대학교
김찬경
1명
2026.09.01 ~ 2027.02.28
2026.09.01 ~ 2028.08.31
1,250만원
1,250만원
기초연구
대학
서울특별시 동작구
생명과학 > 생화학/구조생물학 > 핵산 생화학
... 개발하는 것이다. 이를 위해 동일한 RNA 샘플로부터 Illumina 기반 short-read sequencing과 nanopore 기반 direct RNA sequencing을 함께 수행하고, 두 데이터 세트를 통합 분석함으로써 기존 small RNA sequencing만으로는 한계가 있었던 tsRNA profiling의 정확도를 높이고자 한다. 특히 기존 MODOMICS 기반 reference ...
본 연구에서는 첫째, RNA 전처리 과정의 최적화 및 bias 최소화 조건 확립을 수행하고자 한다. 이를 위해 PNK treatment, deacylation, demethylation과 같은 기존 pretreatment의 필요성을 small RNA sequencing을 통해 재평가하고, northern blot, small RNA RT-PCR, prime...
... tsRNA 및 tRNA modification 상태를 보다 정확하게 반영할 수 있는 새로운 분석 플랫폼으로 활용될 수 있다. 특히 기존 Illumina sequencing만으로는 highly modified ... species를 확인할 수 있는 가능성을 제공한다. 또한 Illumina와 nanopore 데이터를 통합 분석함으로써 높은 depth의 abundance profiling과 modification ...