Development of gastric cancer histology-based prediction models based on the core celluar dynamics of tumor progression and wound healing by single cell and spatial transcriptomes
개인기초연구(과기정통부)(R&D) · 우수연구-핵심연구(유형B)
2026년
2710112080
과학기술정보통신부
한국연구재단
가톨릭대학교산학협력단
김태민
10명
2026.09.01 ~ 2027.08.31
2024.09.01 ~ 2028.08.31
2.4억원
2.4억원
기초연구
대학
서울특별시 서초구
생명과학 > 융합바이오 > 생물정보학
... 특정유전자마커)을 발굴하기 위해 (1) murine wound healing 및 위암scRNA-seq확보, DTW기반 세포역동성분석법정립 및 세포궤적기반 관련마커 확보, (2) 고해상도공간전사체 데이터 생산을 통한 위암미세환경규명 및 발굴된 세포역동성의 조직contexture기반 분석, (3) 이종 및 다중context기반 세포궤적을 통합하는 기법을 통해 단일세포, 공간전사체 간 데이터매핑기법 ...
...hage)의 종간 trajectory비교를 통해 높은 유사성을 갖는 세포군을 dynamic programming기반의 DTW 등의 발전된 비교분석법을 통해 발굴하며 해당분석을 위한 데이터셋 확보(1년차), 발굴된 핵심세포궤적을 조직contexture에서 발굴하기 위한 고해상도 공간전사체데이터 생산 및 기확보된 cell-cell상호작용분석을 위한 방법론 구축(2년차), 발굴된 세포궤적의 ...
...)수준으로 해석하여 공간전사체-암조직이미지 적용을 통해 위암환자의 예후 및 전이를 조기 진단할 수 있는 마커발굴이 가능할 것으로 생각됨. 특히, 이러한 분자-세포궤적의 조직 수준의 발굴을통해 HE염색조직에서 판별할 수 있는 인공지능기반의 판별법을 구축함으로써 임상의 즉각적인 응용이 가능한 전이임상플랫폼을 통해 임상유용성을 연구결과 활용성을 극대화하고자 함.