Data-Parallel Reformulation of Positional Index Scanning (iSCAN): AlgorithmArchitecture Co-Design for Real-Time DNA Data Storage Decoding
이공학학술연구기반구축(R&D) · 석사과정생연구장려금지원
2026년
2340066456
교육부
한국연구재단
인천대학교
조병현
1명
2026.09.01 ~ 2027.08.31
2026.09.01 ~ 2027.08.31
1,200만원
1,200만원
기초연구
대학
인천광역시 연수구
생명과학 > 융합바이오 > 생물정보학
... 디코딩을 활용한 저지연 디코딩 기술을 바탕으로, 초고속 디코딩이 가능하면서도 저사양 컴퓨터에서 구현할 수 있는 고효율 알고리즘을 개발하고 실증하는 것을 목표로 한다. 이는 기존에 상용 소프트웨어인 MATLAB으로 구현되었던 디코딩 엔진을 Python 생태계를 활용한 초고속 디코딩 프로세스로 전환하는 것을 포함한다.1. DNA 디코딩 파이프라인의 데이터 병렬 재정식화 완성. element-wise ...
본 연구는 \"재정식화(reformulation)\"를 중심축으로 한 네 단계의 누적 구조로 구성하였다.(1) 디코딩 파이프라인 프로파일링 및 구조적 regularity 식별. iSCAN 4단계(Primer sorting → KIS 탐지 → Index clustering → Consensus)의 latency를 분해하고, 각 단계에서 데이터 병렬 재정식화의 ...
데이터 생성량의 폭발적 증가로 기존 반도체·자기 저장 매체의 한계가 가시화되면서, 초고밀도·초장기 보존이 가능한 DNA 저장 방식에 대한 산업적 수요가 빠르게 형성되고 있다. 본 연구의 디코딩 알고리즘 고속화는 이 신수요에 직접 대응하는 핵심 기술 요소로, DNA 저장을 \"개념 시연\"에서 \"실용 아카이브 매체\"로 전환하는 엔지니어링 근거를 국내외 반도체·바...