Elucidation of the Role of the Proline-Arginine-Proline(PRP) Motif in Antimicrobial Peptides Based on in silico Modeling and Molecular Dynamics Simulations
개인기초연구(과기정통부)(R&D) · 우수연구-핵심연구(기본연구A)
2026년
2710114187
과학기술정보통신부
한국연구재단
대구경북과학기술원
최승호
1명
2026.09.01 ~ 2027.08.31
2026.09.01 ~ 2029.08.31
4,577만원
4,577만원
기초연구
대학
대구광역시 달성군
물리학 > 복합물리 > 생물물리
본 연구의 최종목표는 프롤린-알지닌-프롤린(PRP) 모티프를 포함한 프롤린 풍부 항균 펩타이드(Proline-Rich Antimicrobial Peptide, PrAMP)의 항균 작용 메커니즘을 전산(in silico) 모델링과 분자동역학(MD) 시뮬레이션을 통해 분자 수준에서 규명하는 것이다. 특히 PRP 모티프가 지질막 접근-인지-초기 결합-삽입-투과에...
본 연구는 대표적 PrAMP인 oncocin(VDKPPYLPRPRPPRRIYNR)과 PR39(RRRPRPPYLPRPRPPPFFPPRLPPRIPPGFPPRFPPRFP, PR39)를 모델 시스템으로 하여, PRP 모티프의 역할을 단계적으로 규명하고 최종적으로 항균 펩타이드 설계 지침을 도출하는 것을 목표로 하며, 연차별 연구는 다음과 같이 구성된다.(a) 1차년도연구목표: ...
[활용계획]본 연구에서 규명되는 PRP(Pro-Arg-Pro) 모티프의 구조적·기능적 역할은 향후 새로운 PrAMP 설계에 직접 활용 가능한 핵심 설계 기반을 제공한다. 먼저 다양한 PRP-type AMP 서열의 반복 패턴, 전하 분포, 길이 및 위치 특성을 비교·분석함으로써 PRP 모티프가 펩타이드의 유연성과 구조적 상태(예: 코일, 턴 등) 분포에 미치...